醫療器械獨立軟件和軟件組件在以下幾個方面存在區別：

功能完整性：醫療器械獨立軟件具有完整的功能，可以獨立完成特定的醫療任務或輔助醫療過程；而軟件組件只是構成醫療器械獨立軟件的各種模塊或子程序，不具備完整的功能。

開發難度和成本：醫療器械獨立軟件的開發難度較大，需要專業的開發團隊來完成；而軟件組件的開發難度較小，可以利用現有的開源庫或第三方SDK來實現。醫療器械獨立軟件的開發成本也較高，而軟件組件的開發成本較低。

運行平臺：獨立軟件(SaMD)是指一種能夠獨立運行于通用計算平臺的軟件，它具有一個或多個醫療目的/用途，無需依賴醫療器械硬件即可實現預期功能。該通用計算平臺需滿足信息技術設備安全要求(包括電磁兼容性)，符合GB 4943.1、GB/T 9254等標準。而軟件組件(SiMD)是指具有一個或多個醫療目的/用途的軟件，用于控制或驅動醫療器械硬件，或運行于醫用計算平臺。醫用計算平臺符合醫用電氣設備(GB 9706系列)、實驗室用電氣設備(GB 4793系列)或有源植入式醫療器械(GB 16174系列)等安全要求(含電磁兼容)。醫用計算平臺可以與通用計算平臺聯合使用，構成一個系統，整體視為醫用計算平臺。

至于醫療器械經營許可證辦理的全部流程，一般包括以下步驟：

企業提出申請：企業向所在地省、自治區、直轄市藥品監督管理部門提出申請。

現場核查：省、自治區、直轄市藥品監督管理部門組織技術審評機構進行現場核查。

審核批準：省、自治區、直轄市藥品監督管理部門對申請資料進行審核，符合要求的批準發給醫療器械經營許可證。