一次性使用軟性輸尿管腎盂電子內窺鏡導管的注冊證辦理需要遵循以下一般流程：

提交申請：當事人需要攜帶身份證件提出申請，并按照規定填寫打印《商標注冊申請書》并加蓋申請人公章、商標圖樣、身份證明文件復印件等。

形式審查：申請遞交后1個月左右，商標局會給下發一個申請受理通知書，進行形式審查。

實質審查：形式審查完畢后，進入實質審查階段，大約需要1年左右。

公告程序：如果實質審查合格，進入公告程序（這個期間是3個月，也叫異議期間）。

拿注冊證：公告期滿，無人提異議的，就可以拿注冊證了。