微生物即個體無法運用肉眼觀察的微小生物總稱；一般微生物涵蓋細菌、真菌、病毒、立克次體、少數藻類等。對人類產生最重要的影響之一的微生物，也會導致傳染病形成。有50%的人類疾病引起原因為病毒。微生物十分微小，需運用顯微鏡放大約千倍才能觀察到。例如1000個中等大小的細菌相疊加后的大小如同句號。由于微生物具有致病性，可導致皮革、布匹、食品等發霉腐爛，微生物也有益處，早期有研究者發現，從青霉菌對其它細菌生長抑制中發現青霉素，對于醫療領域而言屬于跨時代發現。部分微生物被廣泛應用于各種酶制劑、食品、生產乙醇、工業發酵等，還有處于高鹽、低溫、高溫、高輻射、高堿等極端環境中微生物，正因微生物特殊性，凸顯微生物檢驗重要性。

微生物的檢測，無論在理論研究還是在生產實踐中都具有重要的意義。常見的檢測方法有：生長量測定法、微生物計數法、生理指標法和商業化快速微生物檢測等。