申請醫療器械的CE認證時，制造商應準備以下資料：

技術文件：技術文件是CE認證的核心要求之一。它包括產品的設計和制造信息、性能特征、安全性和有效性評估、材料和組件的規格、生產過程的描述等。技術文件應詳盡、準確地描述產品的特性和符合性。

標簽和說明書：制造商應提供產品的標簽和說明書，其中包括產品的使用指南、警告和注意事項、技術規格等。標簽和說明書應符合相關的法規要求，清晰明了地傳達產品的信息。

風險評估：制造商需要進行產品的風險評估，識別和評估潛在的風險，并采取適當的控制措施來確保產品的安全性。風險評估應包括對產品使用中可能出現的危險情況、危險源和風險等級的評估。

性能評估：制造商應根據產品的特性和預期用途進行性能評估。這包括對產品的基本功能、安全性能、穩定性和可靠性等方面進行評估和測試。

質量管理體系：制造商需要建立和實施適當的質量管理體系，以確保產品的質量和符合性。質量管理體系應符合相關的，如ISO 13485。

相關證書和測試報告：制造商應提供與產品相關的證書和測試報告，如材料的安全性評估、生物相容性測試、電磁兼容性測試等。

授權代表文件（如果適用）：如果制造商委托了授權代表來代表其申請CE認證，需要提供授權代表的文件。

以上資料是一般情況下申請醫療器械CE認證所需的基本資料，具體要求可能因產品類型、分類和適用的法規而有所不同。制造商應仔細研究適用的法規和指南，并根據需要尋求的咨詢和指導，以確保準備的資料符合要求。